Корпорация «Главстрой» потеряла возможность влиять на деятельность негосударственного пенсионного фонда «Стройкомплекс», учредителем которого она является. Сейчас орган управления фонда контролируется московскими властями. «Главстрой» будет пытаться решить вопрос через суд.
В июне 2009 года Пресненский суд Москвы признал устав негосударственного пенсионного фонда «Стройкомплекс» незаконным. Дело суд рассматривал по иску бывшего главы этого фонда - Александра Воронина. Он заявлял, что бы уволен незаконно, и требовал также признать недействительным устав, в который были внесены изменения после его увольнения. Таким образом, пункт в новом уставе, регулирующий процедуру и порядок переизбрания совета фонда, также был признан незаконным. На заседаниях совета фонда, состоявшихся осенью 2009 года, из его состава были выведены шесть представителей «Главстроя», одного из основных учредителей фонда с долей в активах НПФ порядка 50%. В результате преимущество в совете получили представители правительства Москвы и компаний, поддерживающих московские власти. В середине января 2010 года НПФ изменил устав, и теперь переизбрать членов совета фонда можно только по инициативе самого совета фонда. Газета «RBCdaily» отмечает, что в данный момент все рычаги управления фондом фактически сосредоточены в руках столичных властей и их сторонников. В «Главстрое» сообщают, что являясь учредителем фонда, предприятие пока не может получить информации о происходящем в фонде и влиять на его деятельность. «Главстрой» намерен добиваться решения данного вопроса через суд.